복합부위 통증 증후군을 발생시키는 원인이나 발병 매커니즘은 아직 규명되지 않았다. 그러나 많은 병례에서 외상을 당한 이후 발생함이 보고되어 있다. 외상의 크기나 정도에 상관 없이, 일상적으로 생기는 아주 사소한 통증[3]으로도 발생할 정도로 원인이 다양하다. 수술 후 재활하며 증후군이 생기는 사례도 있다.

학계에서는 중추신경계와 자율신경계의 문제로, 뇌에 통증 신호가 끊임없이 전달되어 생기는 것으로 추정하고 연구를 지속하고 있다. 마취통증의학과 전문의 엘리엇 크레인(Elliot Krane)은 신경계의 오작동을 원인으로 지적했다.# 그는 인간의 신체와 신경계를 집과 전기회로에 비유한다. 사람들은 당연히 전등 스위치를 올리면 전등이 켜질 것이라고 생각하지만 복합부위 통증 증후군은 마치 집의 전기배선에 문제가 생겨 전등 스위치를 올렸는데 변기 물이 내려간다거나, 컴퓨터 모니터가 꺼지는 것과 마찬가지라는 것이다. 쉽게 말해서 외부로부터 오는 모든 감각들을 하나의 통증으로 인식한다는 것이다.


딱 도살자뎅