세줄 요약 맨아래있음, 배경이 이따위인건 딴데 먼저 올렸다가 그대로 복붙해서그럼, 없에는 방법 모르겠음;;
저는 Callie 대학 면역학 박사 Andrea Cossaizza입니다.
최근들어 뉴에덴에는 이전에 직면한 적 없는 다른 종류의 위협에 처해있습니다. 인간과 캡슐리어 양쪽에게 닥친 코로나바이러스는 빠른속도로 수 많은 사람들에게 전파되고 있으며, 광범위한 증상을 유발하여 싸우기 어렵게 만들고 있습니다. 콩코드의 신속한 대처로 나와 내 동료들은 새로 개발된 프로젝트 디스커버리-유세포 분석 시뮬레이터(flow cytometry simulators)를 통해서 이 병원체를 해독하기 위해서 노력하고 있습니다. 우리는 이 싸움에서 데이터 분석팀에 합류할 당신과 같은 캡슐리어를 찾고 있습니다.
사용될 툴에 대한 간략한 설명과 더불에 급성장중인 분석가로써 당신의 경력을 시작하게 될것니다. 우리는 당신에게 구체적인 방법을 설명하기위해서 몇가지 훈련샘플을 제공할 것이며, 바이러스의 위협이 인간의 면역체계를 어떻게 변화시키는지 이해하는데 도움을 줄 것입니다, 또한 당신의 노력에 대한 보상 역시 제공할 것입니다.
앞서 언급했듯이, 우리 프로젝트의 주요 목적은 코로나 바이러스가 먼역체계에 어떻게 영향을 미치는지 설명하는데 있습니다. 이 정보를 얻기위해서 우리는 유세포 분석기(Flow Cytometer)로 알려진 기계를 이용합니다. 우리는 이 기계를 사용하여 위협이 되는 바이러스의 크기, 모양 그리고 더많은 정보들을 기반으로 바이러스가 어떻게 세포에 영향을 주는지를 이해합니다
유세포 분석기는 여러부분으로 구성되어 있지만 액체로된 연구샘플(대체로 혈액)에서 시작됩니다. 운반되어진 액체는 이 기계장치들의 집합에서 심장과도 같은 micro fludic chip로 운반되게 되는데, 이는 샘플은 장치의 두번째 구성 요소인 레이저에 의해 스캔 될 때 세포가 하나의 라인을 형성하도록 합니다.
micro fludic chip에서 샘플이 내려오는동안 정밀한 레이저 광선이 샘플로 발사됩니다. 샘플에 쏘아진 레이져 광선은 각 세포들의 면역 체계 구조들 비추고 이를 유세포 분석기의 마지막 구성요소인 Optics Subsystem(광학 시스템)이 인식합니다.
발전된 형태로 배열된 센서들은 세포가 직접 투영된 전방산란(Forward Scatter)과 레이저빔으로 인해 일종의 아우라가 투영된 측방산란(Side Scatter) 두가지를 수집합니다. 이 두가지 산란을 결합하여 분석된 차트를 만들어내는데, 이 것은 우리에게 단일 샘플 내에 존재하는 세포 집단의 다양성에대한 이해도를 얻습니다.
한 군집이 어디에서 시작하고 어디에서 끝나는지 이해하는 것은 우리의 방법론적 접근법의 기초이며 신입 연구원중 한사람으로써 주요 임무입니다.
시작해 볼까요?
유세포 분석기에대한 지식을 가지고, 우리의 기계장치들의 조합이 어떻게 데이터를 해석하는지 배워봅시다.
우리는 유세포 분석 데이터와 데이터를 분석하기 위한 실험실의 추적 도구들을 활용하는 방법에 대해 배우게될것입니다.
하지만 당신이 이미 유세포 분석 데이터를 성공적으로 분석하는데 필요한 기술을 가지고 있다고 느낀다면, 바로 뛰어들도록 하십시오
팀에 온걸 환엽합니다 캡슐리어
유세포 분석기를 통한 혈액 분석 결과가 왼쪽에 있습니다.
각 점들은 각각의 세포들을 나타내며, 같은 유형의 세포들은 흔히 우리가 군집(클러스터)으로부르는 그룹으로 구분합니다.
당신의 임무는 각각의 군집을 구분해내는 것이며, 그렇게 함으로써 당신의 동료 과학자들이 바이러스가 우리의 면역체계에 어떻게 영향을 끼치는지 이해하는데 도움을 줍니다.
이제 앞에있는 세포 군집을 “게이팅(분석하고자 하는 부분을 추려내는것)”해봅시다.
이를 위해서 추적 툴로 주변에 폴리곤으로 주변을 감싸야합니다.
파란상자를 클릭하여 첫 게이트를 찍어보세요
첫 게이트를 잘 찍으셨군요. 당신이 해본것처럼 가능한 많은 고유의 세포군집들을 구분해 내는 것이 목표입니다.
하지만 폴리곤을 좀더 좁게 조여볼 수 있는 여지가 보입니다.
당신의 분석 결과를 제출 해보십시오.
당신은 뉴에덴에 닥친 바이러스성 위협에 대처하기 위한 첫 걸음을 내딛었습니다.
훈련을 쌓기위해서 난이도를 높이고 계속 앞으로 나아가십시오
차트를 보면 금색 선과 하이라이트가 눈에 띄는데. 이를 "황금비"라고 할 수 있습니다. 각 샘플을 분석하고 얻는 보상은 이 분석한것이 기준치와 얼마나 밀접하게 일치하느냐에 따라 결정됩니다.
즉, 각 군집의 경계를 구분해네는 것이 목표임을 기억할 필요가 있습니다. 분석을 성공적으로 하기위해선 샘플을 충분히 분석해보는것이 필요합니다.
실전 1
실전2
방법 세줄 요약
1.각각의 세포 군집주위에 점을 찍어 군집을 구분지어놓는다
2.한 폴리곤당 찍을 수 있는점은 10개
3.분석결과 폴리곤 모양이 노란색부분과 일치할 수록 보상이 많아짐
정보추