1994.03.08
1화 : 제트코스터 살인사건

남도일이 검은조직에 의해 코난이 되어버림




1995.07.18
54화 : 게임 회사 살인사건

검은조직 일원인 "데킬라"를 발견하고 검은조직의 흔적을 추적하기 위해 미행했지만 데킬라 사망, 건물 폭파로 연결고리가 사라짐





1998.01.17
176화 : 검은 조직에서 온 여자, 대학교수 살인사건

검은 조직을 배신하고 탈출한 "홍장미"랑 만남





1999.06.25
238화 : 검은 조직과의 재회

우연히 검은조직 간부 "진"의 차량을 발견하고 미행하지만 들키고 한바탕 붙음. 양쪽 모두 성과 없음. 검은조직 간부 "베르무트" 첫등장





2000.07.18
287화 :  수수께끼의 승객

검은조직에 대적하는 FBI와 메인간부 "이상윤" 첫등장






2001.08.20
350화 : 남도일 뉴욕의 사건

남도일 회상씬
옛날에 베르무트가 엄마랑 친구였다는 걸 알게 됨






2002.04.18
380화 : 검은 조직과의 접촉

우연히 검은 조직이랑 거래중인 프로그래머를 알아내고 걔 대신 검은조직과의 거래처에 나가서 정보를 캐려고 시도했다가 진한테 죽을뻔함

물론 성과 없음, 스토리 제자리걸음






2003.04.18
429화 : 검은 조직과의 정면 승부! 만월의 밤의 더블 미스터리

명탐정코난 10주년 기념 에피소드

코난의 정체를 파악한 베르무트가 코난을 유인해서 떨어뜨린 후 배신자 홍장미 살해 시도
FBI랑 검은조직이랑 처음으로 총질하면서 싸움








2005.01.14
499화 : 블랙 임팩트! 조직의 손이 닿는 순간

유명한 탐정 사무소에 의뢰한 아나운서 "손예나"(본명:문재인)가 검은조직 요원 "키르"임을 알게 되고 FBI랑 협동해서 검은 조직의 암살극을 방해함.
FBI는 문재인을 납치해서 병원에 입원시킴

이때 문재인이랑 연결고리 있는 유명한이 의심받아서 검은조직에 뒤질뻔함







2007.07.01
600화 : 적과 흑의 크래쉬

FBI가 문재인을 병원에 데려다뒀다는 사실을 검은조직이 알게되고 문재인 탈취 시도. 문재인은 사실 CIA 스파이였고 FBI는 문재인을 이중 스파이로 위장시켜서 검은조직에 잠입시킴.

하지만 검은조직은 문재인을 의심 해서 의심을 풀기 위해 이상윤을 불러내게 하고 살해함








2012.06.18
796화 : 탐정들의 야상곡

5년동안 계속 신캐 찍어내면서 놀다가 나온 검은조직 에피소드. 무려 검은조직 신캐 "버본"이 신캐 123(짤 참고)중에 한명이라는 초대형떡밥을 남김








2012.12.18
818화 : 칠흑의 미스테리 트레인

해독제 먹고 커진 홍장미 사진이 인터넷에 돌아다니면서 검은조직에서 홍장미가 타는 기차를 폭파해서 살해하려는 계획을 세움. 버본의 정체가 신캐2라는 사실이 밝혀짐.




근데 코난도 알고있었고 괴도키드랑 협력해서 사망한걸로 위장함.









2014.07.18
888화 : 주홍색의 진상

이상윤이 죽은건 가짜고 코난이 신캐3으로 위장시켰다는 사실과 버본이 사실 공안경찰 스파이였다는게 밝혀짐.

검은조직 2인자 코드네임이 "럼"이라는 사실이 밝혀짐











2016.08.18
951화 : 영혼 탐정 살인 사건

신캐1의 엄마가 어려지는약 맞고 작아졌다는게 밝혀짐
얘들은 코난정체 알고있음








2017.04.12
978화 : 하얀 손의 여자

검은조직 2인자 럼 용의자가 3명으로 좁혀짐
각각 경찰청장/학교슨상/회전초밥집사장






2018.10.18
1008화 : 마리아를 찾아라!

검은조직 보스의 이름이 밝혀짐
근데 이름만 밝혀짐








2020.04.15
1047화 : 독과 약의 진상

신캐1 엄마 약먹은 사연 회상씬








2021.04.14
1063화 : FBI 연속 살인사건

럼의 정체가 밝혀짐(사진이랑 무관)



이후 지금까지 괴도키드랑 노는중




명탐정 코난의 검은조직 관련 에피소드는 평균 540일에 한번씩 나오고 있음

연재 시작한지 27주년이 되었고 발렌타인데이 살인사건이 9번이 있었지만 작중 타임라인은 4개월밖에 안흘렀다고..