source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite()
biocLite("OutlierD")
library(Biobase)
openVignette("Biobase")
biocLite("ALL")
library(ALL)
data(ALL)
dat=exprs(ALL)
dim(dat)
f.name=featureNames(ALL)
head(f.name)
s.name=sampleNames(ALL)
head(s.name)
mat = phenoData(ALL)
mat
cl = c(rep(0,95),rep(1,33))
#install.packages("survival")
#library(multtest)
resT = mt.maxT(dat,classlabel = cl,B=1000)
head(resT,n=20)
여기 cl = c(rep(0,95),rep(1,33)) 에서
128열 중 T세포=95, B세포=33 개 라는데요.
ALL 데이터를 아무리 봐도 95와 33 이라는 숫자가 없는데요.
이 숫자는 어떻게 해서 나온건지 문의 좀 올립니다.
cl은 0이 95개고 1이 33개있는거같은데,. 데이터에 95, 33은 명시적으로 안써있겠져. 데이터에 0과 1로 표시된거 개수를 보셈.