단백질에 리간드 랜덤으로 던져서 잘붙는곳 알려주는 스크립트임
빨강색이면 잘붙음
kes09021/RandomEnergyDock (github.com)
GPT5나오면 1인 기업할수있음 ㄹㅇ
저렇게 생긴거는 철공소 지나다 보면 쇠파이프 나선 깍을때 생기더라
이게 먼데 씹덕아
어캐했음? DTI 모델 학습한거임? - dc App
데이터는 어떻게 얻은거? 결합후 입체 구조 변경되는것도 그릴수있음? - dc App
구조변경없고 vina로 도킹시뮬레이션함
아... 걍 mcts 써서 결합위치만 확인해본거? 3차원 입체구조는 smiles같은 표현 기반에서 얻어올 수 있는거임? - dc App
protein 이랑 상호작용이 확실하다고 여겨지는 리간드를 이 스크립트로 돌리면 어느 위치에 결합하는지 예측,시각화할수있도록 하는게 목표였움 단백질구조는 cif db관련사이트에서 받았고 리간드는 Smiles 입력하면됨
흠흠 재밌네 정보 ㄱㅅ 아 근데 공통적인, 비슷한 입체구조가 있는 여러 종류의 리간드들을 동일한 대상이랑 평가해보면 다 다른 위치로 결합하는걸로 결과 나옴? - dc App
아직안해봐썽 ㅎ 해봐야함
ㅋㅋㅋ 홧팅 - dc App
단백질 모형은 뭐 어디서 데이터 가져온거임??
cif database관련 사이트에서 다운받음
저렇게 생긴거는 철공소 지나다 보면 쇠파이프 나선 깍을때 생기더라
이게 먼데 씹덕아
어캐했음? DTI 모델 학습한거임? - dc App
데이터는 어떻게 얻은거? 결합후 입체 구조 변경되는것도 그릴수있음? - dc App
구조변경없고 vina로 도킹시뮬레이션함
아... 걍 mcts 써서 결합위치만 확인해본거? 3차원 입체구조는 smiles같은 표현 기반에서 얻어올 수 있는거임? - dc App
protein 이랑 상호작용이 확실하다고 여겨지는 리간드를 이 스크립트로 돌리면 어느 위치에 결합하는지 예측,시각화할수있도록 하는게 목표였움 단백질구조는 cif db관련사이트에서 받았고 리간드는 Smiles 입력하면됨
흠흠 재밌네 정보 ㄱㅅ 아 근데 공통적인, 비슷한 입체구조가 있는 여러 종류의 리간드들을 동일한 대상이랑 평가해보면 다 다른 위치로 결합하는걸로 결과 나옴? - dc App
아직안해봐썽 ㅎ 해봐야함
ㅋㅋㅋ 홧팅 - dc App
단백질 모형은 뭐 어디서 데이터 가져온거임??
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