์–ธ์–ด์™€ ้ž์–ธ์–ด์˜ ๊ฒฝ๊ณ„๋Š” ์กด์žฌํ•˜๋Š”๊ฐ€? ์ž์—ฐ์–ธ์–ด์˜ ์ˆ˜๋ฆฌ๋ชจ๋ธ์— ์ƒ์ „์ด๊ฐ€ ์—†์Œ์„ ์ฆ๋ช…

https://journals.aps.org/prresearch/abstract/10.1103/PhysRevResearch.4.023156Random



Language Model์ด๋ผ ๋ถˆ๋ฆฌ๋Š” ์ž์—ฐ์–ธ์–ด์˜ ์ˆ˜๋ฆฌ๋ชจ๋ธ์—์„œ ์ƒ์ „์ด(โ€ป)๊ฐ€ ์ผ์–ด๋‚  ์ˆ˜ ์—†๋Š” ์ ์„ ์ฆ๋ช…. ์„ ํ–‰์—ฐ๊ตฌ์—์„œ๋Š” ์–ธ์–ดํš๋“์„ ์ƒ์ „์ด๋กœ ํ•ด์„ํ•˜๊ณ , ์ƒํ™ฉ์ฆ๊ฑฐ๋ฅผ ํ† ๋Œ€๋กœ ์ด ์ƒ์ „์ด๊ฐ€ ์กด์žฌํ•  ๊ฒƒ์„ ์˜ˆ์ƒํ–ˆ์ง€๋งŒ, ๋ณธ ์—ฐ๊ตฌ๋Š” ์ด๋ฅผ ๋ช…ํ™•ํžˆ ๋ถ€์ •ํ•˜์˜€์Œ. ๋ณธ ์—ฐ๊ตฌ๊ฒฐ๊ณผ๋Š”, ์œ ์•„์˜ ๋ฌด์งˆ์„œํ•œ ใ€Œ์–ธ์–ดใ€๋กœ๋ถ€ํ„ฐ ์„ฑ์ˆ™ํ•œ ์–ธ์–ด๋กœ์˜ ๋ณ€ํ™”๋Š” ์—ฐ์†์ ์ธ ๊ฒƒ์ž„์„ ์‹œ์‚ฌ. ๋ณธ ์—ฐ๊ตฌ๋Š” ์ˆ˜๋ฆฌ๋ชจ๋ธ์˜ ํ•ด์„์„ ํ†ตํ•ด ์ž์—ฐ์–ธ์–ด๋ฅผ ์ดํ•ดํ•˜๋Š” ์—ฐ๊ตฌ์˜ ๊ฐ€๋Šฅ์„ฑ์„ ๊ฐœ์ฒ™ํ•˜๋Š” ๊ฒƒ.

โ€ป๋žœ๋คํ•˜๊ฒŒ ๊ฑฐ๋™ํ•˜๋Š” ๋‹ค์ˆ˜์˜ ์š”์†Œ๊ฐ€ ๋ชจ์ธ ๊ณ„์˜ ์–ด๋– ํ•œ ํŒŒ๋ผ๋ฏธํ„ฐ๋ฅผ ์—ฐ์†์ ์œผ๋กœ ์›€์ง์—ฌ ๊ฐ”์„ ๋•Œ์—, ์–ด๋–ค ์ ์—์„œ ๊ณ„์˜ ํ–‰๋™์ด ์งˆ์ ์œผ๋กœ ๋ณ€ํ™”ํ•˜๋Š” ๋ฌผ๋ฆฌ ํ˜„์ƒ. ์ผ์ƒ์ ์œผ๋กœ ๋‚˜ํƒ€๋‚˜๋Š” ์ƒ์ „์ด์—๋Š” ๋ฌผ์ด ์–ผ์Œ์ด ๋˜๋Š” ํ˜„์ƒ์ด ์žˆ์Œ. ๋Œ€๋ถ€๋ถ„์˜ ๊ฒฝ์šฐ ์ƒ์ „์ด์—๋Š” ์ƒˆ๋กœ์šด ์งˆ์„œ์˜ ์ถœํ˜„์ด ๋”ฐ๋ฆ„. ์˜ˆ์ปจ๋Œ€ ์•ก์ฒด์˜ ๋ฌผ์€ ๋žœ๋ค์œผ๋กœ ์šด๋™ํ•˜๋Š” ๋‹ค์ˆ˜์˜ ๋ฌผ๋ถ„์ž ๋ชจ์ž„์ธ๋ฐ ์˜จ๋„๋ฅผ ๋‚ฎ์ถ”๋‹ค ๋ณด๋ฉด ์–ด๋–ค ์˜จ๋„์—์„œ ๋ฌผ๋ถ„์ž๊ฐ€ ์งˆ์„œ์žˆ๋Š” ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ์ด๋ฃจ๋ฉด์„œ ๊ณ ์ฒด์˜ ์–ผ์Œ์ด ๋จ.



์ด์ง• ๊ณ„์‚ฐ๊ธฐ๋กœ ์กฐํ•ฉํ•˜์—ฌ ์ตœ์ ํ™” ๋ฌธ์ œ์˜ '์ฐธ ์ตœ์ ํ•ด'๋ฅผ ๊ณ ์ •๋ฐ€๋„๋กœ ํƒ์ƒ‰

- ๊ตญ์†Œ ์ตœ์ ํ•ด๋กœ๋ถ€ํ„ฐ ํšจ์œจ์ ์œผ๋กœ ํƒˆ์ถœํ•˜๋Š” ๊ธฐ์ˆ ์„ ๊ฐœ๋ฐœ -

https://ieeexplore.ieee.org/document/9783142


ํ˜„์žฌ์˜ ์ด์ง•๊ณ„์‚ฐ๊ธฐ(โ€ป)๋Š” '์ฐธ ์ตœ์ ํ•ด'๋ฅผ ํƒ์ƒ‰ํ•˜๋Š” ๋„์ค‘์— ๊ตญ์†Œ ์ตœ์ ํ•ด์—์„œ ๋ฒ—์–ด๋‚˜์ง€ ๋ชปํ•˜๋Š” ๋ฌธ์ œ๊ฐ€ ์žˆ์—ˆ์Œ. ๋ณธ ์—ฐ๊ตฌ์—์„œ๋Š” ๋‘ ๊ฐœ ํ˜น์€ ๊ทธ ์ด์ƒ์˜ ์Šคํ•€์„ ๊ฒฐํ•ฉํ•˜์—ฌ ํ•˜๋‚˜์˜ ์Šคํ•€์œผ๋กœ ์ทจ๊ธ‰ํ•˜๋Š” ๋ฐฉ๋ฒ•์„ ๊ฐœ๋ฐœํ•จ์œผ๋กœ์จ ๊ตญ์†Œ ์ตœ์ ํ•ด์—์„œ ํƒˆ์ถœํ•˜์—ฌ '์ฐธ ์ตœ์ ํ•ด'๋ฅผ ์–ป๊ธฐ ์‰ฝ๊ฒŒ ํ•˜๋Š” ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ๊ตฌ์ถ•ํ•˜๊ณ , ์ด ๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ์ด์ง• ๊ณ„์‚ฐ๊ธฐ์— ํฌํ•จ์‹œํ‚ค๊ธฐ ์œ„ํ•œ ์•Œ๊ณ ๋ฆฌ์ฆ˜์„ ๊ฐœ๋ฐœ. ๋ณธ ๊ธฐ์ˆ ์„ ๋‹ค์–‘ํ•œ ์ด์ง• ๊ณ„์‚ฐ๊ธฐ์— ์ ์šฉํ•จ์œผ๋กœ์จ ๊ณ ์ •๋ฐ€๋„๋กœ ํ˜„์‹ค์„ธ๊ณ„์˜ ์กฐํ•ฉ ์ตœ์ ํ™” ๋ฌธ์ œ๋ฅผ ํ’€ ์ˆ˜ ์žˆ์œผ๋ฉฐ, ๋™์‹œ์— ๋ฏธ๋ž˜์˜ ์ด์ง• ๊ณ„์‚ฐ๊ธฐ ์•„ํ‚คํ…์ฒ˜์˜ ๋ฐœ์ „์—๋„ ํฌ๊ฒŒ ๊ธฐ์—ฌ.

โ€ป์กฐํ•ฉ ์ตœ์ ํ™” ๋ฌธ์ œ๋ฅผ '์ด์ง• ๋ชจ๋ธ'๋กœ ํ‘œํ˜„ํ•ด ์กฐํ•ฉ ์ตœ์ ํ™” ๋ฌธ์ œ๋ฅผ ํ•ด๊ฒฐํ•˜๋Š” ๊ณ„์‚ฐ๊ธฐ์˜ ์ด์นญ. ์ด์ง• ๋ชจ๋ธ์€ ์›๋ž˜ ์ž์„ฑ์„ ์„ค๋ช…ํ•˜๋Š” ๋ชจ๋ธ๋กœ ํ†ต๊ณ„์—ญํ•™ ๋ถ„์•ผ์—์„œ ๋„์ž….



2์ฐจ์› ๊ฒฐ์ •์˜ ์ ์ธต๊ตฌ์กฐ ์œ ๋ž˜์˜ ์ „๊ธฐ๋ถ„๊ทน์„ ๋ฐ˜์˜ํ•œ ๊ด‘๊ธฐ์ „๋ ฅ ์‘๋‹ต์„ ๋ฐœ๊ฒฌ

- 2์ฐจ์› ๋ฌผ์งˆ์˜ ์ ์ธต ์ž์œ ๋„๋ฅผ ์ด์šฉํ•œ ์ƒˆ๋กœ์šด ๊ธฐ๋Šฅ์„ฑ์˜ ๊ฐ€๋Šฅ์„ฑ -

https://www.nature.com/articles/s41566-022-01008-9


์ ์ธต๋ฐฉํ–ฅ์œผ๋กœ ์ „๊ธฐ๋ถ„๊ทน์„ ๊ฐ€์ง€๋Š” ๋“ฏํ•œ ํŠน์ง•์  ์ ์ธต๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ๊ฐ–๋Š” 2์ฐจ์› ๊ฒฐ์ •์—์„œ ํฐ ๅ…‰๊ธฐ์ „๋ ฅํšจ๊ณผ๊ฐ€ ์‹ค์˜จ์—์„œ ์ƒ๊ธฐ๋Š” ๊ฒƒ์„ ๋ฐœ๊ฒฌ. ๋ถ„๊ทน์„ ๊ฐ–์ง€ ์•Š๋Š” ๋‹จ์ธต์‹œ๋ฃŒ๋‚˜ ๋ณ„๋„์˜ ์ ์ธต๊ตฌ์กฐ๋ฅผ ๊ฐ–๋Š” ์‹œ๋ฃŒ์—์„œ๋Š” ๅ…‰๊ธฐ์ „๋ ฅํšจ๊ณผ๊ฐ€ ์ž‘์Œ์„ ํ™•์ธํ•˜์—ฌ ๊ด€์ธก๋œ ๅ…‰๊ธฐ์ „๋ ฅํšจ๊ณผ๊ฐ€ ์ ์ธต๊ตฌ์กฐ์—์„œ ์œ ๋ž˜ํ•˜๋Š” ๋ถ„๊ทน์„ ๋ฐ˜์˜ํ•œ ๊ฒƒ์ž„์„ ๋ฐํž˜. 2์ฐจ์› ๋ฌผ์งˆ์˜ ์ ์ธต ์ž์œ ๋„๋ฅผ ์ด์šฉํ•œ ๊ธฐ๋Šฅ์„ฑ ๊ฐœ์ฒ™์—์˜ ์ƒˆ๋กœ์šด ๊ฐ€๋Šฅ์„ฑ์„ ๋ฐœ๊ฒฌ.




๋ธŒ๋กœ์ฝœ๋ฆฌ ์œ ๋ž˜ ์„ฑ๋ถ„ ์„คํฌ๋ผํŒ(sulforaphane)์— ์˜ํ•œ ํ•ญ๋น„๋งŒํšจ๊ณผ์˜ ๋ถ„์ž ๋ฉ”์ปค๋‹ˆ์ฆ˜์„ ๊ทœ๋ช…

https://www.nodai.ac.jp/news/article/28078/ ์ด์†Œํ‹ฐ์˜ค์‹œ์•„๋„ค์ดํŠธ(Isothiocyanate) '์„คํฌ๋ผํŒ'์ด ์ „์‚ฌ ์ธ์ž SREBP ํ™œ์„ฑ์„ ์–ต์ œํ•จ์„ ๋ฐํž˜. ์„คํฌ๋ผํŒ์€ ์ „๊ตฌ์ฒด SREBP ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ์— ์ž‘์šฉํ•ด ์œ ๋น„ํ€ดํ‹ด-ํ”„๋กœํ…Œ์•„์†œ ๊ฒฝ๋กœ๋ฅผ ํ†ตํ•œ ๋ถ„ํ•ด๋ฅผ ์ด‰์ง„ํ•จ์„ ๋ฐํ˜”์Œ. ์„คํฌ๋ผํŒ์˜ ์ƒˆ๋กœ์šด ์ž‘์šฉ์  ๊ทœ๋ช…์€ ๊ณผํ•™์  ๊ทผ๊ฑฐ๋ฅผ ๊ฐ€์ง„ ๊ธฐ๋Šฅ์„ฑ ์‹ํ’ˆ์œผ๋กœ ์‘์šฉ๋  ๊ฒƒ์œผ๋กœ ๊ธฐ๋Œ€.



๋ผˆ ๋ถ„ํ™”๋ฅผ ์ด‰์ง„ํ•˜๋Š” ์˜ฌ๋ฆฌ๊ณ DNA๋ฅผ ๋™์ • - ๊ณจ๋‹ค๊ณต์ฆ ์ฐฝ์•ฝ ์‹œ๋“œ๋กœ์„œ ๊ธฐ๋Œ€ -

https://www.mdpi.com/2079-4991/12/10/1680


๋ผˆ ๋ถ„ํ™”๋ฅผ ์ด‰์ง„ํ•˜๋Š” ์˜ฌ๋ฆฌ๊ณ  DNA๋ฅผ๋™์ •. ๋ผˆ์กฐ์ง์˜ ํ•ญ์ƒ์„ฑ์€ ๊ณจ์•„์„ธํฌ์— ์˜ํ•œ ๋ผˆํ˜•์„ฑ๊ณผ ํŒŒ๊ณจ์„ธํฌ์— ์˜ํ•œ ๋ผˆํก์ˆ˜์˜ ๊ท ํ˜•์œผ๋กœ ์œ ์ง€๋˜๊ณ  ์žˆ์œผ๋‚˜, ๋…ธํ™”์— ๋”ฐ๋ผ ๊ณจ์•„์„ธํฌ์˜ ๊ธฐ๋Šฅ์ด ์ €ํ•˜๋˜๋ฉด ๊ณจ ๋ฆฌ๋ชจ๋ธ๋ง์˜ ๊ท ํ˜•์ด ๊นจ์ง€๊ณ  ๊ณจ๋Ÿ‰๊ณผ ๊ณจ๋ฐ€๋„๊ฐ€ ๊ฐ์†Œํ•ด ๊ณจ๋‹ค๊ณต์ฆ์˜ ์›์ธ์ด ๋˜๋ฏ€๋กœ, ๊ณจ์•„์„ธํฌ๋ฅผ ํ™œ์„ฑํ™”ํ•˜๊ณ  ๊ณจ๋ถ„ํ™”๋ฅผ ์ด‰์ง„ํ•˜๋Š” ๋ถ„์ž๋Š” ๊ณจ๋‹ค๊ณต์ฆ์˜ ์‹ ์•ฝ ์‹œ์ฆˆ(seeds)๊ฐ€ ๋  ๊ฒƒ์œผ๋กœ ์ƒ๊ฐ. ๋ณธ ์—ฐ๊ตฌํŒ€์€ ์ด์ „์— ๊ทผ๋ถ„ํ™”๋ฅผ ์œ ๋„ํ•˜๋Š” ์˜ฌ๋ฆฌ๊ณ  DNA๋ฅผ ๋ฐœ๊ฒฌํ–ˆ๊ธฐ ๋•Œ๋ฌธ์— ๊ณจ๋ถ„ํ™”๋ฅผ ์ด‰์ง„ํ•˜๋Š” ์˜ฌ๋ฆฌ๊ณ  DNA๋„ ์กด์žฌํ•˜์ง€ ์•Š์„๊นŒ ์ƒ๊ฐํ•˜์—ฌ ์‹คํ—˜์„ ์‹ค์‹œํ•œ ๊ฒฐ๊ณผ, ์œ ์‚ฐ๊ท ์˜ ๊ฒŒ๋†ˆ ๋ฐฐ์—ด์—์„œ ์œ ๋ž˜ํ•œ 44๊ฐ€์ง€ ์˜ฌ๋ฆฌ๊ณ  DNA ์ค‘์—์„œ ๋งˆ์šฐ์Šค ๊ณจ์•„์„ธํฌ์˜ ๋ถ„ํ™”๋ฅผ ์ด‰์ง„ํ•˜๋Š” 'iSN40'์ด๋ผ๋Š” 18์—ผ๊ธฐ ๋ฐฐ์—ด์˜ ๋™์ •์— ์„ฑ๊ณต. iSN40์—๋Š” ๊ณจ๋ถ„ํ™”์— ํ•„์š”ํ•œ ์œ ์ „์ž์˜ ๋ฐœํ˜„์„ ์œ ๋„ํ•ด ์นผ์Š˜์ด ์นจ์ฐฉํ•œ ๊ณจ์„ธํฌ์— ์„ฑ์ˆ™์‹œํ‚ค๋Š” ์ž‘์šฉ์ด ์žˆ์Œ์„ ํ™•์ธ. iSN40์€ ๊ณจ์•„์„ธํฌ๋ฅผ ํ™œ์„ฑํ™”ํ•˜๋Š” ์˜ฌ๋ฆฌ๊ณ  DNA๋กœ์„œ ๊ณจ๋‹ค๊ณต์ฆ ์น˜๋ฃŒ์— ์œ ์šฉํ•œ ํ•ต์‚ฐ์˜์•ฝํ’ˆ์œผ๋กœ์„œ์˜ ์‘์šฉ์ด ๊ธฐ๋Œ€.






๋ณ‘๋ฆฌ์กฐ์ง ํ™”์ƒ์œผ๋กœ๋ถ€ํ„ฐ ์•”์˜ ์œ ์ „์ž ์ด์ƒ์„ ์˜ˆ์ธกํ•˜๋Š” ์‹ ๊ทœ ์Šคํฌ๋ฆฌ๋‹ ์‹œ์Šคํ…œ Virtual Sequencing์„ ๊ฐœ๋ฐœ - ๋ณ‘๋ฆฌํ•™๊ณผ AI์˜ ํ˜‘๋™์— ์˜ํ•œ ์ฐจ์„ธ๋Œ€ ๋ณ‘๋ฆฌํ•™ ์ฐฝ์ƒ์„ ๋ชฉํ‘œ๋กœ - https://aacrjournals.org/clincancerres/article/doi/10.1158/1078-0432.CCR-21-4391/694681/Rapid-Screening-Using-Pathomorphologic ์‹ฌ์ธตํ•™์Šต์„ ์ด์šฉํ•˜์—ฌ ์ œ์ž‘๋œ ๋ณ‘๋ฆฌ์กฐ์งํ•™์  ํŠน์ง• ๊ฒ€์ถœ๊ธฐ๋ฅผ ์‚ฌ์šฉํ•˜๊ณ , ๊ธฐ์กด์— ์—†๋˜ ์‹ ๊ทœ ๋ฐฉ๋ฒ•์œผ๋กœ ์œ ์ „์ž ์ด์ƒ ๊ฒ€์ถœ๊ธฐ๋ฅผ ์ œ์ž‘. 33๊ฐœ์˜ ๋ณ‘๋ฆฌ์กฐ์งํ•™์  ํŠน์ง• ์ค‘ 12๊ฐœ์™€ 27๊ฐœ์˜ ํŠน์ง•์— ๋Œ€ํ•ด AUC(โ€ป)๊ฐ€ ๊ฐ๊ฐ > 0.90๊ณผ > 0.80์„ ๋‹ฌ์„ฑ. 2๊ฐœ์˜ ๋ณ‘๋ฆฌ ํ˜•ํƒœํ•™์  ํŠน์ง•์˜ ์กฐํ•ฉ์— ์˜ํ•œ, ๋Œ€์žฅ์•”์˜ ์œ ์ „์ž ์ด์ƒ ์˜ˆ์ธก์˜ 2๊ฐœ์˜ ๋…๋ฆฝ๋œ ์ฝ”ํ˜ธํŠธ๋ฅผ ์ด์šฉํ•œ ๊ฒ€์ฆ์—์„œ, BRAFV600E(AUC 0.851๊ณผ 0.859)์™€ MSI-H(AUC 0.923๊ณผ 0.862)์— ๋Œ€ํ•ด ๋†’์€ ์ •๋ฐ€๋„๋กœ ์œ ์ „์ž ์ด์ƒ์„ ๊ฒ€์ถœ. โ€ปROC๊ณก์„ ์„ ์ž‘์„ฑํ–ˆ์„ ๋•Œ ๊ทธ๋ž˜ํ”„ ๊ณก์„ ๋ณด๋‹ค ์•„๋žซ๋ถ€๋ถ„ ๋ฉด์ ์„ AUC(Area Under the Curve)๋ผ๊ณ  ํ•จ. AUC๋Š” 0๋ถ€ํ„ฐ 1๊นŒ์ง€์˜ ๊ฐ’์„ ์ทจํ•˜๋ฉฐ ๊ฐ’์ด 1์— ๊ฐ€๊นŒ์šธ์ˆ˜๋ก ํŒ๋ณ„๋Šฅ์ด ๋†’๋‹ค๋Š” ์ ์„ ๋‚˜ํƒ€๋ƒ„.