일단 본인이 추려보기로는 대략 네가지 같음.

1. 지나친 완행위주의 운영(9호선 1호선 빼고 급행이 급행답게 다니는데 있나)
2. 환승저항을 유발시키는 동선 설계(영등포ㅡ여의도, 서울역ㅡ강남대로, 서울역ㅡ잠실 전부 다 환승이 필요하다?)
3. 부실한 정기권 시스템(1일권 1주일권 부재 뿐 아니라 버스ㅡ지하철 통합정기권 이런게 없다)
4. 장거리에 대해 지나치게 싼 운임(체감상 5km 이내는 드럽게 비싼데 50km쯤 가면 거리에 비해 겁나게 싼값이 되어버림)

그외의 문제점으로 뭐가있을까...